Article original datant du 22/05/22
L’Institut de Virologie de Wuhan a assemblé un génome du virus de la variole du singe, permettant ainsi d’identifier le virus par des tests PCR, en utilisant une méthode que les chercheurs ont signalée comme pouvant créer un « agent pathogène contagieux », peut révéler The National Pulse.
L’étude a été publiée pour la première fois en février 2022, quelques mois seulement avant la dernière épidémie internationale de cas de variole du singe, qui semble avoir atteint les États-Unis.
L’article, rédigé par neuf chercheurs de l’Institut de Virologie de Wuhan et publié dans la revue scientifique trimestrielle Virologica Sinica du laboratoire, fait également suite à l’utilisation à grande échelle de tests de réaction en chaîne par polymérase (PCR) pour identifier les individus positifs au COVID-19.
Les chercheurs semblent avoir identifié une partie du génome du virus de la variole du singe, permettant aux tests PCR d’identifier le virus, dans l’article : « Assemblage efficace d’un grand fragment du génome du virus de la variole du singe en tant que modèle de qPCR en utilisant la recombinaison associée à la transformation basée sur la double sélection ».
Les virus de la variole du singe – appelés « MPXV » dans l’article – ont des souches qui sont « plus pathogènes et [ont] été signalées comme infectant les humains dans diverses parties du monde. »
« La réaction en chaîne par polymérase quantitative (qPCR) est l’étalon-or pour la détection des orthopoxvirus (y compris les MPXV). Pour la détection des pan-orthopoxvirus, il a été démontré que le gène E9L (ADN polymérase) est une excellente cible pour les tests qPCR. Pour la détection du MPXV, Li et son équipe ont signalé que le gène C3L (protéine de liaison au complément) pouvait être utilisé comme cible du qPCR pour la souche MPXV du bassin du Congo », explique le journal avant de noter que la Chine ne dispose pas d’informations génétiques suffisantes sur le virus pour la détection par PCR :
« La contamination par le MPXV n’ayant jamais été associée à une épidémie en Chine, le matériel génomique viral nécessaire à la détection par qPCR n’est pas disponible. Dans ce rapport, nous avons utilisé la RAT à double sélectivité pour assembler un fragment génomique MPXV de 55 kb qui englobe E9L et C3L, deux cibles qPCR précieuses pour la détection du MPXV ou d’autres orthopoxvirus. »
« Le but premier de l’assemblage d’un fragment du génome du MPXV est de fournir une matrice de nucléotides pour la détection du MPXV », réitère l’étude, qui s’est appuyée sur le processus de recombinaison associée à la transformation (TAR) pour isoler un fragment génomique du virus de la variole du singe.
« En tant qu’outil efficace pour assembler de grands fragments d’ADN jusqu’à 592 kb de longueur, l’assemblage TAR est devenu essentiel pour préparer des clones infectieux de grands virus ADN/ARN », expliquent les chercheurs.
Le document reconnaît que le TAR « appliqué à la recherche virologique pourrait également soulever des problèmes de sécurité potentiels, en particulier lorsque le produit assemblé contient un ensemble complet de matériel génétique qui peut être récupéré dans un agent pathogène contagieux. »
« Dans cette étude, bien qu’un génome viral complet serait le modèle de référence idéal pour détecter le MPXV par qPCR, nous avons seulement cherché à assembler un fragment viral de 55 kb, soit moins d’un tiers du génome du MPXV. Ce produit d’assemblage est sûr en éliminant pratiquement tout risque de se transformer en un virus infectieux tout en fournissant de multiples cibles qPCR pour la détection du MPXV ou d’autres orthopoxvirus », ont affirmé les chercheurs.
Cette étude s’ajoute au fait que l’Institut de Virologie de Wuhan a mené des recherches similaires sur des souches de coronavirus de chauve-souris susceptibles d’infecter les humains, tout en admettant que ses installations ne disposaient pas des protocoles de sécurité de laboratoire appropriés.
1-s2.0-S1995820X22000414-main by Natalie Winters
